Полный список можно посмотреть на google scholar. Ниже я выделил публикации по старению, патенты по старению, публикации по физике, и мою кандидатскую диссертацию по физике в качестве бонуса.
публикации по старению
Сотрудничество OpenAI и Retro Biosciences
OpenAI и Retro Biosciences успешно разработали GPT‑4b micro — миниатюрную версию GPT‑4o, специализированную для белковой инженерии, и использовали её для создания новых, значительно улучшенных вариантов факторов Яманаки.
Природа эпигенетического старения с точки зрения одиночных клеток.
A.E. Tarkhov, T. Lindstrom-Vautrin, S. Zhang, K. Ying, M. Moqri, B. Zhang, A. Tyshkovskiy, O. Levy, V.N. Gladyshev.
Nature of epigenetic aging from a single-cell perspective.
Nature Aging 4, 854–870 (2024).
10.1038/s43587-024-00616-0
Часы старения, энтропия и проблема обращения возраста.
A.E. Tarkhov, K.A. Denisov, P.O. Fedichev.
Aging Clocks, Entropy, and the Challenge of Age Reversal.
Aging Biology 2, e20240031 (2024).
10.59368/agingbio.20240031
Универсальная транскриптомная сигнатура возраста выявляет временное масштабирование траекторий старения Caenorhabditis elegans.
A.E. Tarkhov, R. Alla, S. Ayyadevara, M. Pyatnitskiy, L.I. Menshikov, R.J. Shmookler Reis, P.O. Fedichev.
A universal transcriptomic signature of age reveals the temporal scaling of Caenorhabditis elegans aging trajectories.
Scientific Reports 9, 7368 (2019).
10.1038/s41598-019-43075-z
Корреляция Стрелера-Милдвана — вырожденное многообразие подгонки Гомперца.
A.E. Tarkhov, L.I. Menshikov, P.O. Fedichev.
Strehler-Mildvan correlation is a degenerate manifold of Gompertz fit. Journal of Theoretical Biology 416, 180–189 (2017).
10.1016/j.jtbi.2017.01.017
Лонгитюдный анализ маркеров крови выявляет прогрессирующую потерю устойчивости и предсказывает предельную продолжительность жизни человека.
T.V. Pyrkov, K. Avchaciov, A.E. Tarkhov, L.I. Menshikov, A.V. Gudkov, P.O. Fedichev.
Longitudinal analysis of blood markers reveals progressive loss of resilience and predicts ultimate limit of human lifespan.
Nature Communications 12, 2561 (2021).
10.1038/s41467-021-23014-1
Бремя редких повреждающих вариантов в зародышевой линии негативно влияет на здоровье и продолжительность жизни человека.
A.V. Shindyapina, A.A. Zenin, A.E. Tarkhov, D. Santesmasses, P.O. Fedichev, V.N. Gladyshev. Germline burden of rare damaging variants negatively affects human healthspan and lifespan.
eLife 9, e53449 (2020).
10.7554/eLife.53449
Обучение без учителя принципам старения на основе лонгитюдных данных.
K. Avchaciov, M.P. Antoch, E.L. Andrianova, A.E. Tarkhov, L.I. Menshikov, O. Burmistrova, A.V. Gudkov, P.O. Fedichev.
Unsupervised learning of aging principles from longitudinal data.
Nature Communications 13, 6529 (2022).
10.1038/s41467-022-34051-9
Эпигенетический возраст, обогащённый причинно-следственными связями, разделяет повреждение и адаптацию.
K. Ying, H. Liu, A.E. Tarkhov, M.C. Sadler, A.T. Lu, M. Moqri, S. Horvath, Z. Kutalik, X. Shen, V.N. Gladyshev. Causality-enriched epigenetic age uncouples damage and adaptation.
Nature Aging 4, 231–246 (2024).
10.1038/s43587-023-00557-0
PRC2-AgeIndex как универсальный биомаркер старения и омоложения.
M. Moqri, ..., A.E. Tarkhov, ..., V.N. Gladyshev, S. Horvath, M.P. Snyder, V. Sebastiano. PRC2-AgeIndex as a universal biomarker of aging and rejuvenation.
Nature Communications 15, 5956 (2024). 10.1038/s41467-024-50098-2
Разногласия по фундаментальным принципам биологического старения.
V.N. Gladyshev, ..., A.E. Tarkhov, ..., A. Zhavoronkov.
Disagreement on foundational principles of biological aging. PNAS Nexus 3, pgae499 (2024).
10.1093/pnasnexus/pgae499
Эпигенетическое профилирование и частота нарушений развития указывают на гаструляцию как точку отсчёта старения у Xenopus laevis.
B. Zhang, A.E. Tarkhov, ..., V.N. Gladyshev.
Epigenetic profiling and incidence of disrupted development point to gastrulation as aging ground zero in Xenopus laevis.
bioRxiv (2022).
10.1101/2022.08.02.502559
патенты по старению
- Методы, композиции и соединения для лечения возрастных заболеваний и состояний (приоритетная дата 9 февраля 2022) US20250276066A1
- Соединения, композиции и методы для лечения возрастных заболеваний и состояний (приоритетная дата 10 февраля 2021) WO2022173333A2, EP4291239A2
- Методы оценки биологического возраста и системы, использующие такиу методы (приоритетная дата 16 января 2020) WO2021145798A2, US20220351865A1
- Устройства, методы, композиции и системы для лечения старения и возрастных заболеваний (приоритетная дата 17 июля 2018) WO2020018005A1, US20210260113A1
публикации по физике
Транзиентное упорядочение в решётке Гросса-Питаевского после энергетического скачка в неупорядоченной фазе.
A.E. Tarkhov, A.V. Rozhkov, B.V. Fine. Transient ordering in the Gross-Pitaevskii lattice after an energy quench within a nonordered phase.
Phys Rev B 106, L201110 (2022).
10.1103/PhysRevB.106.L201110
Динамика топологических дефектов после фотоиндуцированного плавления волны зарядовой плотности.
A.E. Tarkhov, A.V. Rozhkov, B.V. Fine. Dynamics of topological defects after photoinduced melting of a charge density wave.
Phys Rev B 106, L121109 (2022).
10.1103/PhysRevB.106.L121109
Оценка времени эргодизации хаотической многочастичной системы из обращения времени равновесного шума.
A.E. Tarkhov, B.V. Fine. Estimating ergodization time of a chaotic many-particle system from a time reversal of equilibrium noise.
New J Phys 20, 123021 (2018).
10.1088/1367-2630/aaf0b6
Извлечение показателей Ляпунова из эхо-динамики конденсатов Бозе-Эйнштейна на решётке.
A.E. Tarkhov, S. Wimberger, B.V. Fine. Extracting Lyapunov exponents from the echo dynamics of Bose-Einstein condensates on a lattice.
Phys Rev A 96, 023624 (2017).
10.1103/PhysRevA.96.023624
Универсальность фазового перехода типа Березинского-Костерлица-Таулесса в дипольной XY-модели.
A.Y. Vasiliev, A.E. Tarkhov, L.I. Menshikov, P.O. Fedichev, U.R. Fischer. Universality of the Berezinskii–Kosterlitz–Thouless type of phase transition in the dipolar XY-model.
New J Phys 16, 053011 (2014).
10.1088/1367-2630/16/5/053011
Двухстадийный механизм формирования упорядоченных поверхностных наноструктур при атомном осаждении.
V.I. Emel'yanov, A.E. Tarkhov.
Two-stage mechanism of formation of ordered surface nanostructures under atomic deposition.
Comput Nanotechnol 4, 37 (2015).
mathnet.ru/rus/cn51
Фазово-когерентный электронный транспорт в асимметричных крестообразных интерферометрах Андреева.
P.E. Dolgirev, M.S. Kalenkov, A.E. Tarkhov, A.D. Zaikin. Phase-coherent electron transport in asymmetric crosslike Andreev interferometers.
Phys Rev B 100, 054511 (2019).
10.1103/PhysRevB.100.054511
кандидатская диссертация по теоретической физике
Динамика эргодизации уравнения Гросса-Питаевского на решётке.
A.E. Tarkhov.
Ergodization dynamics of the Gross-Pitaevskii equation on a lattice.
(Кандидатская диссертация, научный руководитель Борис В. Файн).
Сколковский институт науки и технологий, Москва, Россия (2020).